Ngay sau khi xảy ra sự việc, Hội đồng tư vấn chuyên môn đánh giá tai biến trong quá trình sử dụng vắc xin, sinh phẩm y tế đã tiến hành điều tra toàn bộ quy trình tiêm chủng, bảo quản vắc xin, đồng thời Công an tỉnh Đồng Tháp đã tiến hành giám định pháp y. 

Sau khi phân tích, hội đồng đưa ra kết luận ban đầu là có thể trẻ tử vong do sặc sữa, không có bằng chứng tử vong có liên quan đến vắc xin và tiêm chủng.