Tại hội nghị, đại biểu tham luận nêu một số tồn tại, hạn chế trong quá trình thực hiện như phần lớn hoạt động Dự án triển khai vào giai đoạn cuối ảnh hưởng đến chất lượng, hiệu quả; năng lực cán bộ, điều kiện vật chất ở cơ sở không đồng đều nên việc khai thác, sử dụng trang thiết bị y tế được hỗ trợ chưa cao... 

Đồng thời thống nhất một số giải pháp thời gian tiếp theo nhằm phát huy hiệu quả Dự án. Đó là, tiếp tục tham mưu với Sở Y tế giao chỉ tiêu phát triển chuyên môn kỹ thuật tại cơ sở; phối hợp với ngành bảo hiểm xã hội thanh toán chi phí khám, chữa bệnh ở trạm y tế xã, phường, thị trấn; các đơn vị thụ hưởng Dự án quản lý, khai thác, sử dụng tốt trang thiết bị, góp phần nâng cao chất lượng bảo vệ, chăm sóc sức khỏe nhân dân.